三澄美琴（石原里美 饰）是在民间法医组织“UDI”工作的女法医，该组织专门接收由于非正常原因导致死亡的遗体，对其进行解剖以求找到案件的真相。和美琴一起工作的，还有法医中堂系（井浦新 饰）、记录员九部六郎（洼田正孝 饰）和检查技师东海林夕子（市川实日子 饰）等人。

涩谷站前广场发生了多人受伤的爆炸事件。警部补志村贵文（高桥一生饰）在等待支援时，街头播放着神秘男子的新爆炸预告影像，他要求用志村交换下一次爆炸的情报。志村去了指定的地方，等待他的是神秘的女人桐子（柴崎幸饰）。桐子告诉他，犯罪分子是自称“烟花师”的爆破专家，过去作为事故处理的几起爆炸事件都是他所为，并预告会再次发生爆炸事件。志村无法相信桐子的话，但为了阻止进一步的爆炸，与桐子一起隐匿了行踪。另一方面，搜查一课对桐子列举的几起事故重新调查。结果发现，其中一个事故，为凶恶犯罪分子进行交易的犯罪协调者“Invisible”被怀疑参与其中。

影片改编自同名小说，是以误解开始、交换日记为轴心展开的青春爱情故事。高桥饰演学校最受欢迎的男生濑户山润，樱田饰演过于察言观色的笨拙女生黑田希美。