东京都高度育成高中，是以升学率、就业率100%为荣，每月支付相当于10万日元金钱的梦想学校。但是，其内在是只有一部分成绩优秀者才能得到好待遇的实力至上主义学校。 　　迎来第3学期，从D班晋升为C班的绫小路等人前往林间学校。在那里实施的是被称为“混合集训”的全年级联合进行的特别考试。就像它的名字一样，按男女分开，必须结成由多个班级人员混合的小组，以该小组为单位进行评分的考试。 　　如果不与一直以来作为敌人而竞争的其他班级的学生们合作，就无法获得高分，而且最重要的是，在没有达到分数线的小组中将有人退学。 　　动荡的第3学期即将拉开帷幕！

——赌上一切去挑战。上吧，才能的原石们啊。改变时代的，是我们“Blue Lock（蓝色监狱）”—— 　　为了培育出带领日本获得W杯优胜的射手，日本足联设立了“Blue Lock（蓝色监狱）”计划。 　　被邀请参与计划的是300名高中生。 　　而且全员都是FW（前锋）。 　　身处一旦被淘汰就会失去将来加入日本足球代表资格的极限状态下，被选中的才能的原石们逐渐觉醒了身为射手的Ego。 　　时而踢落他人，时而凭自身的进化从严苛的选拔中生存下来的35人。 　　跨越了盘旋着Ego的、狂热的生存战的他们，赌上“Blue Lock（蓝色监狱）”计划的存续，向与U-20日本代表展开的史上最疯狂的决胜赛（Big Match）发起挑战！ 　　现在，为了将自己的Ego铭刻于世，为了亲手改变命运，史上最炽热的战斗<比赛>即将开始。