商业犯罪搜查科警司黄文彬（林家栋 饰）的妻子前往廉政公署举报丈夫巨额现金来路不明，廉记首席调查主任陆志廉（古天乐 饰）奉命传唤黄到署问话，然而对手老奸巨猾，深谙暗箱一切套路，最终平安脱险。此前不久，黄曾调查素有香港会计界教父之称的罗德永（卢海鹏 饰）未果，视频中二人的反常举止引起陆的怀疑。与此同时，身份难辨的Z基金在道貌岸然的律师胡志勇（王敏德 饰）的推动下即将上市，该基金打着扶贫旗号，有望吸引港府150亿的专项关怀基金投入其中。陆敏感察觉其中的蹊跷，他和同事利用有限的时间展开全面调查。 金钱巨大的诱惑之下，贪婪之徒铤而走险，更不惜为此杀人嗜血。狂扫污秽的Z风暴即将到来，黑云压城城欲摧……

1991年，香港九龙发生了一起特大珠宝抢劫案。当晚，两名劫匪死于分赃现场，鬼王雷飞扬连同赃物销声匿迹，九龙重案组戴耀廷一道江湖追杀令，揭开横跨两代人之间的恩仇暗战。金盆洗手的黑帮头目成为餐厅老板，贪欲熏心的昔日黑警如今功成名就，重投社会的罪犯之子在末路挣扎。亦敌亦友的警方卧底，忠义两难的寡言保镖，怀揣黑金的私家侦探，循循善诱的天真义工，背负愧疚的年轻妻子，神志不清的癫疯老妇……25年前的黑白无间，25年后的因果有报，每个人做过的事，始终都要还。